Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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GRIK5Q16478 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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GRIK5Q16478 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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GRIK5Q16478 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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GRIK5Q16478 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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GRIK5Q16478 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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GRIK5Q16478 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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GRIK5Q16478 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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