Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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