Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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