Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SS18Q15532 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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