Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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SEC23BQ15437 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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SEC23BQ15437 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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