Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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