Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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