Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms