Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms