Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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CKAP5Q14008 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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CKAP5Q14008 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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CKAP5Q14008 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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CKAP5Q14008 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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