Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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