Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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