Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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