Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms