Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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