Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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