Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms