Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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ITGB3BPQ13352 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
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ITGB3BPQ13352 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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ITGB3BPQ13352 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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ITGB3BPQ13352 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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ITGB3BPQ13352 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
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ITGB3BPQ13352 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
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ITGB3BPQ13352 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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ITGB3BPQ13352 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ITGB3BPQ13352 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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