Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.8 ms