Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIN2BQ13224 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.9 ms