Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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IFT88Q13099 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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IFT88Q13099 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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IFT88Q13099 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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IFT88Q13099 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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IFT88Q13099 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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IFT88Q13099 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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IFT88Q13099 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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