Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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TP53BP1Q12888 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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TP53BP1Q12888 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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TP53BP1Q12888 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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TP53BP1Q12888 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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TP53BP1Q12888 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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TP53BP1Q12888 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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TP53BP1Q12888 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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TP53BP1Q12888 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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TP53BP1Q12888 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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TP53BP1Q12888 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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TP53BP1Q12888 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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TP53BP1Q12888 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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TP53BP1Q12888 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TP53BP1Q12888 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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