Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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RAB40BQ12829 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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RAB40BQ12829 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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RAB40BQ12829 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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RAB40BQ12829 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RAB40BQ12829 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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