Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
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PTPRMP28827 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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PTPRMP28827 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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PTPRMP28827 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
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