Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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HOXD1Q9GZZ0 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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