Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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