Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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RTL3Q8N8U3 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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RTL3Q8N8U3 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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