Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PHYHD1Q5SRE7 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms