Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTU2Q2VPK5 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms