Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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