Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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RTN1Q16799 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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RTN1Q16799 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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RTN1Q16799 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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RTN1Q16799 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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