Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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