Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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RPE65Q16518 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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RPE65Q16518 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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RPE65Q16518 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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RPE65Q16518 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
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RPE65Q16518 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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RPE65Q16518 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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