Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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SNCBQ16143 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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SNCBQ16143 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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SNCBQ16143 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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SNCBQ16143 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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SNCBQ16143 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNCBQ16143 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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