Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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