Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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