Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RFTN1Q14699 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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RFTN1Q14699 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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RFTN1Q14699 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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RFTN1Q14699 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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RFTN1Q14699 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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RFTN1Q14699 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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RFTN1Q14699 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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RFTN1Q14699 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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RFTN1Q14699 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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RFTN1Q14699 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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RFTN1Q14699 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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