Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DSC3Q14574 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms