Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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