Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CTTNQ14247 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTTNQ14247 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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