Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDK13Q14004 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms