Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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PDE6HQ13956 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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PDE6HQ13956 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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PDE6HQ13956 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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PDE6HQ13956 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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PDE6HQ13956 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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PDE6HQ13956 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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PDE6HQ13956 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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