Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms