Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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