Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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PKP1Q13835 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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PKP1Q13835 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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PKP1Q13835 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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PKP1Q13835 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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