Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
APOFQ13790 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
APOFQ13790 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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APOFQ13790 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
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APOFQ13790 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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