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| RUNX3 | Q13761 | AC096736.1-201 | ENST00000512609 | 947 nt | TSL 3 BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU1-41P-201 | ENST00000516161 | 162 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC109329.2-201 | ENST00000519658 | 482 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AP003122.3-201 | ENST00000526316 | 255 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP003033.1-201 | ENST00000527244 | 415 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC079907.1-201 | ENST00000552707 | 374 nt | TSL 3 BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MED28P6-201 | ENST00000558776 | 231 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC046158.1-201 | ENST00000563408 | 719 nt | TSL 3 BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087463.1-201 | ENST00000568541 | 556 nt | TSL 2 BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LIVAR-201 | ENST00000578633 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005304.3-201 | ENST00000581533 | 511 nt | TSL 3 BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01899-202 | ENST00000583756 | 575 nt | TSL 3 BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073648.5-201 | ENST00000603502 | 305 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | MIER3-203 | ENST00000381213 | 5198 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FKTN-204 | ENST00000448551 | 1700 nt | TSL 2 BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LRRC49-224 | ENST00000560691 | 2531 nt | TSL 2 BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |