Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms