Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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