Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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PTCH1Q13635 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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PTCH1Q13635 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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PTCH1Q13635 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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PTCH1Q13635 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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PTCH1Q13635 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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PTCH1Q13635 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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PTCH1Q13635 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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PTCH1Q13635 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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