Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRPF4BQ13523 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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